Игрок выступит яко одного из солдат-клонов Replica под кодовым именем Foxtrot813. Он начинает определяться под влияние Альмы и в конечном счете начинает воевать против своих сослуживцев. Таким образом игровой ход получился довольно оригинальным и не похожим на прочие части.